Buenas Leo,
Es lo que te comentaba anteriormente
.comments-area {
display: none;
}
Esto lo que hace es que desaparezca la caja de comentarios de la pagina de cara al usuario pero no de cara a google porque va a leer los comentarios por duplicado, entonces no es una buena opcion porque lo que hace es ocultar la caja pero no la elimina.
Donde se encuentra la opcion que comentas al principio de eliminar los comentarios no le encuentra por ninguna parte:
Como puedo acceder a esa parte? donde esta en generatepress?
Un saldo